Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOXD4L1Q9NU39 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXD4L1Q9NU39 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXD4L1Q9NU39 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms