Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP8A2Q9NTI2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP8A2Q9NTI2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP8A2Q9NTI2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP8A2Q9NTI2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP8A2Q9NTI2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP8A2Q9NTI2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP8A2Q9NTI2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms