Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF275Q9NSD4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms