Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3GQ9NS98 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA3GQ9NS98 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3GQ9NS98 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms