Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHST12Q9NRB3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHST12Q9NRB3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms