Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF3Q9NR81 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms