Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

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Length 1,180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP13A2Q9NQ11 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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