Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKKSQ9NPJ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MKKSQ9NPJ1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms