Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNW7

TXNRD2, Thioredoxin reductase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD2Q9NNW7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TXNRD2Q9NNW7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TXNRD2Q9NNW7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNRD2Q9NNW7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TXNRD2Q9NNW7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TXNRD2Q9NNW7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNRD2Q9NNW7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms