Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1549Q9HCM3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms