Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHEJ1Q9H9Q4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHEJ1Q9H9Q4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms