Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRDE2Q9H7Z3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NRDE2Q9H7Z3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms