Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PARLQ9H300 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARLQ9H300 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARLQ9H300 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms