Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00597Q9H2U6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00597Q9H2U6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms