Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIK2Q9H0K1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK2Q9H0K1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms