Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF541Q9H0D2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF541Q9H0D2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF541Q9H0D2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms