Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NYXQ9GZU5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NYXQ9GZU5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NYXQ9GZU5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NYXQ9GZU5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NYXQ9GZU5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NYXQ9GZU5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NYXQ9GZU5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NYXQ9GZU5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NYXQ9GZU5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NYXQ9GZU5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms