Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms