Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP44Q9C0F1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms