Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNTNAP4Q9C0A0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CNTNAP4Q9C0A0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms