Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CPEB1Q9BZB8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms