Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ4

TRIM34, Tripartite motif-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM34Q9BYJ4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM34Q9BYJ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM34Q9BYJ4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM34Q9BYJ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms