Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CADM1Q9BY67 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CADM1Q9BY67 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM1Q9BY67 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms