Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1QTNF3Q9BXJ4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QTNF3Q9BXJ4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms