Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SALL3Q9BXA9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SALL3Q9BXA9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SALL3Q9BXA9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.4 ms