Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP58Q9BVL2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP58Q9BVL2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms