Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC32Q9BV29 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC32Q9BV29 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms