Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC39A3Q9BRY0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A3Q9BRY0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms