Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR0

ZKSCAN3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3Q9BRR0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZKSCAN3Q9BRR0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZKSCAN3Q9BRR0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZKSCAN3Q9BRR0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms