Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPIN3Q9BQK8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPIN3Q9BQK8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LPIN3Q9BQK8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms