Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMCHL2Q9BQD1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMCHL2Q9BQD1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms