Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP2Q99959 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP2Q99959 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms