Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT1Q99946 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
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PRRT1Q99946 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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