Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYSTQ99698 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms