Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHOX2BQ99453 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms