Protein–RNA interactions for Protein: Q96S96

PEBP4, Phosphatidylethanolamine-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEBP4Q96S96 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEBP4Q96S96 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEBP4Q96S96 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEBP4Q96S96 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEBP4Q96S96 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PEBP4Q96S96 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEBP4Q96S96 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEBP4Q96S96 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms