Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNT1Q96Q11 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRNT1Q96Q11 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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