Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD6Q96NE9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms