Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG8Q96MW5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG8Q96MW5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms