Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ROBO3Q96MS0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ROBO3Q96MS0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms