Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
STAC3Q96MF2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.82■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.78■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.77■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
STAC3Q96MF2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
STAC3Q96MF2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
STAC3Q96MF2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
STAC3Q96MF2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
STAC3Q96MF2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
STAC3Q96MF2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
STAC3Q96MF2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
STAC3Q96MF2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
STAC3Q96MF2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
STAC3Q96MF2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STAC3Q96MF2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STAC3Q96MF2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
STAC3Q96MF2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STAC3Q96MF2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms