Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX27Q96L92 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX27Q96L92 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX27Q96L92 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms