Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPTM1LQ96KA5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPTM1LQ96KA5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms