Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
LRRIQ1Q96JM4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
LRRIQ1Q96JM4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LRRIQ1Q96JM4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms