Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TPD52L3Q96J77 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms