Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZBED3Q96IU2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED3Q96IU2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED3Q96IU2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
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