Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM17Q96I25 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBM17Q96I25 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RBM17Q96I25 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms