Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNF8Q96H20 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms