Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRMT2BQ96GJ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT2BQ96GJ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT2BQ96GJ1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms