Protein–RNA interactions for Protein: Q96F85

CNRIP1, CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1Q96F85 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNRIP1Q96F85 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNRIP1Q96F85 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNRIP1Q96F85 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNRIP1Q96F85 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNRIP1Q96F85 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms